產(chǎn)前篩查和產(chǎn)前診斷是出生缺陷二級(jí)預(yù)防中的關(guān)鍵環(huán)節(jié),技術(shù)在不斷推陳出新,更新迭代,普及針對(duì)染色體疾病的產(chǎn)前篩查和診斷對(duì)降低出生缺陷的發(fā)生有著重要的意義。婦產(chǎn)科網(wǎng)攜手安諾優(yōu)達(dá)特邀國(guó)內(nèi)產(chǎn)前診斷領(lǐng)域?qū)<?/span>云南省第一人民醫(yī)院朱寶生教授探討CNV-seq技術(shù)在臨床應(yīng)用的熱點(diǎn)問題。
朱寶生教授指出,胎兒染色體病,特別是導(dǎo)致嚴(yán)重臨床后果的胎兒染色體病,在活產(chǎn)嬰兒中的占比大約為0.8%-1.2%,另外,特納綜合征、克氏綜合征等疾病雖然出現(xiàn)明顯智力低下癥狀的情況不多,但依然會(huì)出現(xiàn)其他嚴(yán)重的臨床表現(xiàn),因此預(yù)防出生缺陷最基本的任務(wù)是要預(yù)防染色體病。
20年前在沒有基因測(cè)序這些分子生物學(xué)檢測(cè)手段之下,通過細(xì)胞培養(yǎng)進(jìn)行細(xì)胞染色體核型分析,能夠診斷出唐氏綜合征、克氏綜合征、特納綜合征這些染色體數(shù)目異常,以及一小部分染色體大片段缺失或重復(fù),但該檢測(cè)手段只能使嬰兒的死亡率降低到1%左右。隨著熒光原位雜交技術(shù)、熒光定量PCR檢測(cè)、染色體芯片等逐漸應(yīng)用到產(chǎn)前診斷領(lǐng)域,胎兒染色體病以及胎兒染色體微缺失綜合征的產(chǎn)前診斷能力也逐漸得到提高?,F(xiàn)在拷貝數(shù)變異檢測(cè)技術(shù)的出現(xiàn),對(duì)胎兒染色體病以及由胎兒染色體異常所造成的罕見病有了更強(qiáng)的診斷和預(yù)防能力。
朱教授表示,相較傳統(tǒng)的細(xì)胞遺傳學(xué)檢查,CNV-seq檢測(cè)能夠多發(fā)現(xiàn)大約0.8%具有臨床意義的染色體異常,在過去,使用常規(guī)的細(xì)胞遺傳學(xué)檢查,染色體微重復(fù)微缺失綜合征容易被大量漏診,現(xiàn)在不但不會(huì)漏診,甚至還能夠在產(chǎn)前診斷的病例中意外發(fā)現(xiàn)以外顯子拷貝缺失/重復(fù)為變異特征的DMD單基因病。CNV-seq檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用于臨床后,嬰兒死亡率在云南省第一人民醫(yī)院已經(jīng)下降到1.1‰,這是圍產(chǎn)保健歷史上最好的成績(jī)。
朱教授希望未來產(chǎn)前診斷新技術(shù)(如二代測(cè)序、三代測(cè)序)能有進(jìn)一步的應(yīng)用與發(fā)展,同時(shí)也期待十年以后活產(chǎn)嬰兒死亡率能夠降低到萬分之一。
眾所周知,臨床上為老百姓提供的服務(wù)和技術(shù)都必須是合規(guī)、合法的,產(chǎn)前診斷也不例外,未經(jīng)過嚴(yán)格評(píng)審和考核的技術(shù)與產(chǎn)品,是不能夠隨意應(yīng)用到產(chǎn)前診斷中的。新發(fā)布的CNV-seq產(chǎn)品,是全球第一款經(jīng)過國(guó)家權(quán)威部門評(píng)審認(rèn)定考核后,被授予三類醫(yī)療器械資質(zhì)的試劑盒,可用來檢測(cè)胎兒的染色體非整倍體以及染色體的拷貝數(shù)變異。CNV-seq檢測(cè)能夠一次性檢測(cè)出胎兒染色體數(shù)目異常以及染色體上可能存在的微缺失、微重復(fù)拷貝數(shù)變異。通常情況下,細(xì)胞遺傳分析可以檢測(cè)出染色體數(shù)目異常,但在光學(xué)顯微鏡下無法觀察出微小的拷貝數(shù)變異,所以就需要使用DNA測(cè)序或者其它分子生物學(xué)檢測(cè)方法來進(jìn)行檢測(cè)。
在過去,需要使用兩種不同的技術(shù)同時(shí)檢測(cè)一個(gè)樣本才有可能把染色體的數(shù)目異常以及拷貝數(shù)變異檢測(cè)出來,現(xiàn)在有了CNV-seq技術(shù),一次試驗(yàn)就可以滿足以上兩個(gè)方面的臨床需求,這對(duì)于諸多罕見病的預(yù)防有著重要的意義。目前已知因染色體拷貝數(shù)變異導(dǎo)致的罕見病多達(dá)幾百種,CNV-seq檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用之后,經(jīng)過檢測(cè)的胎兒出生后基本上不會(huì)患因拷貝數(shù)變異所導(dǎo)致的罕見病。
從2019年開始,云南省第一人民醫(yī)院與全國(guó)其他四家單位共同完成了CNV-seq檢測(cè)試劑盒的臨床試驗(yàn)。該臨床試驗(yàn)采用細(xì)胞培養(yǎng)核型分析與包括CNV-seq在內(nèi)的多種技術(shù)進(jìn)行對(duì)比研究,針對(duì)真實(shí)產(chǎn)前診斷病例中胎兒的染色體非整倍體以及一部分拷貝數(shù)變異所導(dǎo)致的微缺失綜合征,進(jìn)行檢測(cè)效能的客觀測(cè)評(píng)。朱寶生教授表示,該試驗(yàn)技術(shù)難度較高,經(jīng)歷了四年時(shí)間才順利完成,在這期間不僅需要對(duì)各類病人在不同場(chǎng)景下測(cè)評(píng)試劑盒的檢測(cè)能力,看是否能檢測(cè)出拷貝數(shù)變異的病例,還需要與其他的技術(shù)進(jìn)行充分對(duì)比驗(yàn)證,包括能否驗(yàn)證出客觀存在的拷貝數(shù)變異、能否檢測(cè)出染色體的非整倍體嵌合體,以及檢測(cè)能力是否與染色體芯片技術(shù)一致等等。通過在幾千個(gè)病例中進(jìn)行獨(dú)立的、背靠背的試驗(yàn),用統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)來驗(yàn)證和考評(píng)CNV-seq技術(shù)產(chǎn)品是否優(yōu)于其他的技術(shù)產(chǎn)品。最終的結(jié)果是:對(duì)比其他技術(shù)手段,CNV-seq檢測(cè)技術(shù)是最準(zhǔn)確、最靈敏,對(duì)樣本要求最低的產(chǎn)前診斷技術(shù)。
朱教授講到他們科室在試驗(yàn)期間也做了相關(guān)研究,在孕婦知情同意的情況下,同時(shí)使用細(xì)胞培養(yǎng)核型分析方法及CNV-seq方法對(duì)9452個(gè)胎兒的羊水和臍帶血樣本進(jìn)行平行檢測(cè),觀察兩種方法的檢測(cè)結(jié)果是否一致以及確認(rèn)CNV-seq是否能夠發(fā)現(xiàn)新的疾病。最終的研究結(jié)果不出所料,在這9452個(gè)病例中,細(xì)胞培養(yǎng)核型分析方法未能成功檢測(cè)出52個(gè)病例,這就相當(dāng)于產(chǎn)前診斷失敗,而CNV-seq成功檢測(cè)出了全部病例,所以從可靠性及對(duì)DNA樣本的要求來說,CNV-seq技術(shù)表現(xiàn)最佳。
對(duì)于核型分析檢出的染色體三體綜合征病例,CNV-seq全部能夠檢測(cè)出來;對(duì)于核型分析檢出的嵌合體病例, CNV-seq能夠分析出10%以上的嵌合體,但對(duì)于3%、5%和7%這類低于10%的嵌合體CNV-seq難以判斷,不能得出明確結(jié)論,但好在臨床上這種低比例的嵌合體非常少見,臨床上實(shí)際的漏診概率也是很低的。再有就是嵌合比例越低,對(duì)臨床后果和臨床表現(xiàn)的影響就越輕,所以10%以下嵌合體的漏診,客觀上對(duì)臨床的影響并不是太大。另外,對(duì)于染色體平衡易位和染色體倒位,CNV-seq是檢測(cè)不出來的,但目前大部分研究表明,染色體平衡易位和倒位不會(huì)導(dǎo)致發(fā)育上的異常,對(duì)個(gè)體發(fā)育來說不具有臨床意義,所以即便CNV-seq檢測(cè)不出也是臨床上可以接受的。而染色體平衡易位和倒位可以通過核型分析輕而易舉發(fā)現(xiàn)。因此臨床試驗(yàn)制定了這樣一個(gè)規(guī)則:做產(chǎn)前診斷,CNV-seq一般情況下不獨(dú)立使用,而是與細(xì)胞培養(yǎng)核型分析聯(lián)合檢測(cè),這樣可以避免遺漏染色體平衡易位和倒位的病例。
另外一種情況是核型分析中看到的染色體是正常的,而CNV-seq檢測(cè)卻能夠發(fā)現(xiàn)致病性的拷貝數(shù)變異。在9452個(gè)病例中,82個(gè)病例在光學(xué)顯微鏡下染色體是正常的,但CNV-seq檢測(cè)出了會(huì)導(dǎo)致胎兒患病的拷貝數(shù)變異。變異不同,臨床癥狀以及疾病的嚴(yán)重程度也是不同,其中44個(gè)病例會(huì)導(dǎo)致非常嚴(yán)重的臨床后果,比如早期死亡、嚴(yán)重的智力低下及多發(fā)畸形,CNV-seq技術(shù)在產(chǎn)前診斷中及時(shí)發(fā)現(xiàn)了這44個(gè)病例。
CNV-seq技術(shù)應(yīng)用于臨床后,產(chǎn)前診斷的質(zhì)量和效能都得到了大幅的提升,朱教授稱,對(duì)這九千多個(gè)檢測(cè)結(jié)果正常的胎兒出生后進(jìn)行了隨訪,結(jié)果很是欣慰:新生嬰兒出生缺陷率只有1.28%,死亡率1.1‰,出生缺陷率和死亡率都是全國(guó)平均值的1/3。CNV-seq技術(shù)加入產(chǎn)前診斷后,絕大多數(shù)致病致死的出生缺陷都將被發(fā)現(xiàn)和預(yù)防,活產(chǎn)嬰兒的健康質(zhì)量得到大幅度的提高,未來在全國(guó)推廣使用后,一定會(huì)為國(guó)家出生缺陷防控事業(yè)貢獻(xiàn)新的力量。
從臨床試驗(yàn)及科室研究的結(jié)果來看,朱教授認(rèn)為,CNV-seq未來一定會(huì)成為產(chǎn)前診斷的常規(guī)必用技術(shù)。現(xiàn)在云南沒有CNV-seq技術(shù)的部分醫(yī)院或產(chǎn)前診斷機(jī)構(gòu),已經(jīng)主動(dòng)委托云南省第一人民醫(yī)院開展CNV-seq檢測(cè),他們可以在本醫(yī)院對(duì)病例進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)核型分析,然后送來5ml羊水樣本進(jìn)行CNV-seq檢測(cè),病人拿到產(chǎn)前診斷結(jié)果時(shí)既有細(xì)胞培養(yǎng)核型分析的結(jié)果也有CNV-seq檢測(cè)結(jié)果,這樣,醫(yī)生在進(jìn)行產(chǎn)前診斷臨床咨詢的時(shí)候,有了更為豐富的診斷參考信息,對(duì)于出生缺陷防控的咨詢也會(huì)給出更好的意見和結(jié)果。依照云南目前的應(yīng)用情況,CNV-seq檢測(cè)一定會(huì)迅速地在全國(guó)得到推廣及應(yīng)用。
朱教授介紹,研究以及臨床試驗(yàn)的考核評(píng)價(jià)方案是這樣設(shè)計(jì)的:首先,選擇臨床上有可疑致病風(fēng)險(xiǎn)的病例,比如包括染色體非整倍體、染色體非整倍體的嵌合體以及染色體的片段缺失/重復(fù),甚至預(yù)料不到的單基因或少數(shù)基因片段的缺失和重復(fù);然后將這些病例進(jìn)行CNV-seq檢測(cè),CNV-seq技術(shù)檢測(cè)基因組是沒有選擇性的,無論是胎兒、流產(chǎn)組織,甚至不孕癥門診病人、兒科門診病人,都能夠準(zhǔn)確地檢測(cè)出基因組中100kb以上的片段缺失或者片段重復(fù)。
人類的基因組含有31億個(gè)堿基對(duì),任何一個(gè)染色體上片段的缺失都可能導(dǎo)致幾個(gè)、幾十個(gè)、上百個(gè)基因的丟失,反過來片段重復(fù)也是如此,可能導(dǎo)致幾個(gè)基因、幾十個(gè)、上百個(gè)基因的重復(fù),因此就可能因?yàn)槿笔Ш椭貜?fù)導(dǎo)致基因功能的異常。如果缺失的片段所對(duì)應(yīng)的等位片段上出現(xiàn)致病的突變或者喪失功能的突變,那么就會(huì)出現(xiàn)出生缺陷和罕見病。正是因?yàn)镃NV-seq技術(shù)的出現(xiàn),才使大家對(duì)出生缺陷、先天性疾病及部分罕見病的認(rèn)識(shí)比過去更為清晰。
產(chǎn)前診斷是預(yù)防出生缺陷的關(guān)鍵措施,安諾優(yōu)達(dá)自主研發(fā)的CNV-seq檢測(cè)試劑盒是首個(gè)獲得國(guó)家藥監(jiān)局III類醫(yī)療器械注冊(cè)證的檢測(cè)試劑盒,是我國(guó)出生缺陷防控體系中的一個(gè)重要里程碑。CNV-seq技術(shù)具有檢測(cè)范圍廣、高通量、操作簡(jiǎn)便、兼容性好、可檢測(cè)低比例嵌合體、可進(jìn)行低DNA樣本量檢測(cè)等優(yōu)勢(shì),為臨床產(chǎn)前診斷及遺傳基因排查等提供了更優(yōu)選的解決方案,這將開啟國(guó)內(nèi)產(chǎn)前檢測(cè)領(lǐng)域的新篇章,助力我國(guó)出生缺陷防控體系工作邁上新的臺(tái)階。
主任技師,云南省第一人民醫(yī)院醫(yī)學(xué)遺傳科主任,昆明理工大學(xué)教授,博士生導(dǎo)師
擔(dān)任國(guó)家衛(wèi)生健康委全國(guó)產(chǎn)前診斷專家組成員
國(guó)家衛(wèi)生健康委西部?jī)?yōu)生與出生缺陷防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室常務(wù)副主任
中國(guó)優(yōu)生科學(xué)協(xié)會(huì)副會(huì)長(zhǎng)
中國(guó)優(yōu)生科學(xué)協(xié)會(huì)出生缺陷防控專委會(huì)主任委員
中國(guó)醫(yī)師協(xié)會(huì)醫(yī)學(xué)遺傳醫(yī)師分會(huì)常委
中華醫(yī)學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)委員會(huì)委員
中國(guó)婦幼保健協(xié)會(huì)地中海貧血防治專委會(huì)副主委等學(xué)術(shù)任職
發(fā)表論文220多篇,擔(dān)任《中國(guó)實(shí)用婦科與產(chǎn)科雜志》、《中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志》等雜志編委,榮獲第四屆中國(guó)出生缺陷干預(yù)救助基金會(huì)科學(xué)技術(shù)杰出貢獻(xiàn)獎(jiǎng)等省部級(jí)科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)27項(xiàng)。
責(zé)任編輯:孫雯