北醫(yī)三院脊柱外科是國內最強的學科，生殖醫(yī)學中心的治療方法最全面、規(guī)模是國際最大之一，中國大陸首例試管嬰兒在此誕生。運動醫(yī)學研究所是新中國最早成立、國內唯一的中國奧委會指定運動員傷病防治中心。眼科在眼外傷、角膜移植、白內障和青光眼等方面處于國內第一方陣；消化科在潰瘍病發(fā)病機制研究及治療、早期胃癌的診療等領域居國內前列；心血管內科在冠心病介入治療、心臟病人康復治療、心血管臨床與基礎協(xié)調發(fā)展等方面成績突出；成形科、職業(yè)病科是國內率先成立的臨床特色學科。

　　經過幾代人的共同努力，北醫(yī)三院已躋身國內三甲醫(yī)院第一方陣。醫(yī)院擁有20個國家臨床重點專科：骨科、藥劑科（臨床藥學）、病理科、?？谱o理、檢驗科、消化科、婦科、產科、職業(yè)病科、耳鼻喉科、心血管分子生物學與調節(jié)肽重點實驗室、呼吸內科、神經內科、普通外科、泌尿外科、眼科、麻醉科、康復醫(yī)學科、成形科（整形外科）、運動醫(yī)學科。婦產科為國家婦產疾病臨床醫(yī)學研究中心，產科、康復醫(yī)學科為國家產科專業(yè)、國家康復醫(yī)學醫(yī)療質量管理和控制中心。